De geschiedenis van Doggenhout gaat terug tot 1186, toen het voor het eerst in historische bronnen werd vermeld. In het begin van de 13de eeuw kwam de heerlijkheid in het bezit van Walter Berthout I van Berchem. Ze werd vervolgens opgenomen in de heerlijkheid Ranst-Berchem, waarvan Doggenhout de zetel werd. Daarmee kreeg het domein een belangrijke bestuurlijke en juridische betekenis binnen de lokale heerlijkheidsstructuur.
De heerlijkheid bleef tot 1407 in handen van de familie Van Berchem. Daarna kwam ze in het bezit van de familie Van Liere. Vanaf de 16de eeuw wisselde Doggenhout meermaals van eigenaar en volgden verschillende adellijke families en andere bezitters elkaar op. In 1610-1613 werd het kasteel in opdracht van Jeanne de Rovelasca uitgebreid en kreeg het de functie van hof van plaisantie, een adellijk buitenverblijf.
De donjon dateert uit de eerste helft van de 14de eeuw en vormt een van de oudste bewaarde onderdelen van het kasteel. Van het historische complex zijn ook zandstenen fundamenten, de dubbele omgrachting en de toren bij de toegangspoort bewaard gebleven.
Tot in de 17de eeuw waren er twee donjons, waarvan één als vrijstaande toren fungeerde. De combinatie van deze elementen weerspiegelt de middeleeuwse oorsprong van het domein en zijn vroegere versterkte karakter.
Kort na 1895 liet Jean-Corneille Adriaenssen het kasteel restaureren naar een ontwerp van architect J.A. Van der Gucht. In het tweede kwart van de 20ste eeuw volgde een nieuwe restauratie, waardoor de historische structuur en het karakter van het waterslot grotendeels behouden bleven.
In de jaren 1970 kwam Doggenhout in het bezit van Albert Moorkens, een nazaat van Lodewijk Moorkens, die decennialang burgemeester van Borgerhout was. De familie Moorkens verwierf haar vermogen als vetweiders, die runderen op eigen weiden vetmestten. Ook Alberts echtgenote, Constance Belpaire, was afkomstig uit een welgestelde familie. Met de aankoop van Doggenhout werd het historische domein onderdeel van het familiepatrimonium.
De familie Moorkens is vooral bekend als de grondlegger van de holding Alcopa. Albert Moorkens bouwde het familiebedrijf verder uit met de import van motorfietsen en auto's. Het bedrijf groeide uit tot een belangrijk familieconcern. In 2009 werden zijn kinderen door koning Albert II in de adelstand verheven en kregen zij de titels van baron en barones.
Vandaag maakt kasteel Doggenhout deel uit van het familiepatrimonium van de familie Moorkens. Het domein wordt door de familie gebruikt en onderhouden. Het waterslot bewaart daarmee nog steeds de sporen van zijn middeleeuwse oorsprong en de vele veranderingen die het domein door de eeuwen heen heeft ondergaan.